El Patronato es el órgano superior de gobierno. Fija las líneas básicas de actuación de la Fundación, define los objetivos fundacionales, y vela por el cumplimiento de sus objetivos.

Presidente

El Presidente de la Comunidad de Madrid

Vicepresidente
Primero

El Presidente del Canal de Isabel II

Vicepresidente
Segundo

La Consejera de Empleo, Turismo y Cultura

Vocal

El Director General de Canal de Isabel II Gestión S.A.

Secretario

El Secretario del Consejo de Administración del Canal de Isabel II

Sin perjuicio de las funciones de alto gobierno y representación que corresponden al patronato, es a la Dirección-Gerencia de la Fundación a quien compete su funcionamiento, gestión y administración, siendo responsable de éstos ante los órganos de gobierno.